Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DenrQ9CQJ6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms