Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms