Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms