Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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