Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAPERQ9BY12 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms