Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim26Q99PN3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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