Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms