Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcam1Q99NB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms