Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Tdrd1Q99MV1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Tdrd1Q99MV1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd1Q99MV1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms