Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh4Q99MT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms