Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms