Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5rap3Q99LM2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms