Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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SmagpQ99KC7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SmagpQ99KC7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SmagpQ99KC7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
SmagpQ99KC7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SmagpQ99KC7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SmagpQ99KC7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SmagpQ99KC7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms