Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms