Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GatbQ99JT1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms