Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ddb2Q99J79 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ddb2Q99J79 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ddb2Q99J79 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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