Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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