Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms