Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TardbpQ921F2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TardbpQ921F2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms