Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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