Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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