Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd1Q8VCZ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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