Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcaQ8VC88 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms