Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BbxQ8VBW5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BbxQ8VBW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms