Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms