Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r200Q8R281 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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