Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms