Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf183Q8QZS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf183Q8QZS5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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