Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms