Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hacd3Q8K2C9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hacd3Q8K2C9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hacd3Q8K2C9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hacd3Q8K2C9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hacd3Q8K2C9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hacd3Q8K2C9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms