Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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