Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms