Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms