Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7cQ8C6E1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms