Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp1Q8C4U3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms