Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Als2cr12Q8BVM7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms