Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zfp398Q8BV16 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Zfp398Q8BV16 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Zfp398Q8BV16 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zfp398Q8BV16 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zfp398Q8BV16 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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