Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms