Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp54Q8BL06 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms