Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms