Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trmt12Q8BG71 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms