Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Klhl42Q8BFQ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Klhl42Q8BFQ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Klhl42Q8BFQ9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Klhl42Q8BFQ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Klhl42Q8BFQ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Klhl42Q8BFQ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Klhl42Q8BFQ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klhl42Q8BFQ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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