Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms