Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms