Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc1Q80VQ1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms