Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms