Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms