Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf8Q80TJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms