Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms