Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms